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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

222

NOMBRE DE NOTICES

72

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

87 %

MOTS CLES

Heavy metal resistance Bacteroidetes Complete genome Archaea Acid mine drainage AMD Mineral weathering Biofilm Nitrification Horizontal gene transfer Holobiont Cyanobacteria Agrobacterium tumefaciens Bactérie Thermophile Nitrogen fixation Acinetobacter baumannii Magnetotactic bacteria Pathogenicity Continuous culture Metagenomics Fish-pathogenic bacteria Coevolution Lactobacillus Polyphasic taxonomy Nitrogen fixing Bacterial Dehalogenation Metabolomics Flavobacteriaceae Oxidative stress Phylogeny Genome evolution Iron uptake Genome-scale metabolic networks Fish pathogens Natural products Microbiology Bacteriophage Flavobacterium psychrophilum Formate assimilation Molecular evolution Evolution Arsenic Proteomics Experimental evolution Genome mining Legume-rhizobium symbiosis Metabolism Clostridioides difficile Virulence factors Fish pathogen Activated sludge Rhizobium CTX-M-15 ACL HGT Average nucleotide identity Metabolic networks Secondary metabolites Pangenome Gene regulation Fitness cost ESBL Insect Bioremediation Directed evolution Genome sequence Lactic acid bacteria Food Marine bacteria Actinorhizal symbiosis Alkaline thermal spring Functional genomics Bacterial genetics Genomes Genome Comparative genomics Functional annotation Mobile genetic elements Microbial genomics Bacteria Magnetotaxis Bacteriocin Dichloromethane Aquaculture Hydrothermal Gut microbiota Biodiversity Transcriptome Adaptation DDDH Anaerobic Virulence Digital DNA-DNA hybridization Symbiosis Transcriptomics Brochothrix thermosphacta Escherichia coli Genomics Betaproteobacteria